Thời kỳ đầu mới thành lập, Cơ sở II tập trung vào việc xây dựng cơ sở vật chất và công tác đào tạo là chính. Chỉ bắt đầu từ năm 1997 công tác NCKH mới bắt đầu được triển khai. Mặc dù lực lượng cán bộ khoa học còn mỏng, khối lượng giảng dạy lại khá lớn, một số giảng viên lại kiêm nhiệm công tác quản lý, song công tác NCKH cả trong cán bộ giảng viên và sinh viên và đã đạt được những kết quả khả quan và ngày càng tiến bộ.
Với mục tiêu nhanh chóng áp dụng các tiến bộ về khoa học kỹ thuật vào thực tiễn sản xuất đồng thời đưa các kinh nghiệm từ thực tế vào giảng đường, Cơ sở II đã tăng cường hợp tác với các sở, ngành, các địa phương và các doanh nghiệp theo thỏa thuận mà Nhà trường đã ký kết như với Sở GTVT Cần Thơ, Bình Thuận, Tây Ninh, Ban Quản lý dự án 7,... Cơ sở II đã tổ chức hoặc phối hợp tổ chức thành công nhiều Hội thảo khoa học, thu hút được sự quan tâm của nhiều nhà khoa học, doanh nghiệp, nhà quản lý, giảng viên và sinh viên với các đối tác như Tập đoàn thép Nippon (Nhật Bản), Hội đồng Anh và Sterling Group, công ty xi măng Holcim…
Một điểm sáng trong hoạt động NCKH là đã phối hợp tổ chức được nhiều Hội thảo quốc tế như: tổ chức Hội thảo quốc tế AITC, phối hợp với Đại học Feng Chia (Đài Loan) tổ chức Hội thảo quốc tế “Xây dựng thành phố thông minh tại Việt Nam: tầm nhìn và giải pháp” vào ngày 5/9/2018. Hội thảo đã thu hút sự quan tâm của hàng trăm nhà khoa học, nhà quản lý, các doanh nghiệp trong và ngoài nước, các cơ quan thông tấn báo chí. Thành công của các buổi Hội thảo đã góp phần nâng cao vị thế của Nhà trường nói chung và Phân hiệu nói riêng ở trong nước cũng như trong khu vực.
Hội thảo đào tạo và nghiên cứu khoa học năm 2000
Hội thảo 15 năm xây dựng và phát triển Cơ sở II năm 2005
Ký kết hợp tác về đào tạo và khoa học công nghệ năm 2006
Nghiệm thu đề tài NCKH Sinh viên năm 2008
Tổ chức Báo cáo chuyên đề nền tảng Cisco cho sinh viên Phân hiệu năm 2014
Lễ ký thoả thuận hợp tác xuất bản tạp chí 3 trường năm 2015
Nghiệm thu đề tài KHCN cấp Thành phố của TS. Ngô Châu Phương năm 2015
Phối hợp với Sở Giao thông Vận tải TP. HCM tổ chức Hội thảo Mô hình
phát triển trung tâm điều hành giao thông thông minh TP.HCM năm 2016
Hội thảo quốc tế SmartCity năm 2018
Hội thảo quốc tế AITC được tổ chức tại Phân hiệu năm 2020
